په ژیجنګ ولایت کې د بروسیلا ابورټس لومړی بشپړ جینوم پر بنسټ د تعقیب وړتیا تحلیل - د میکرو او مایکرو ټیسټ څخه بایو انفارمیټکس ټیم په ګډه خپرونه کې مرسته کوي

—— د ژیجنګ سي ډي سي، میکرو او مایکرو ټیسټ، او چین سي ډي سي لخوا د همکارۍ مطالعه په فرنټیرز ان سیلولر او انتان مایکروبیولوژي کې خپره شوې

د مطالعې عمومي کتنه

د ۲۰۲۶ کال په می میاشت کې، د حجروي او انتاني مایکروبیولوژي فرنټیرز (JCR Q1, IF ≈ 4.6) د ژیجیانګ د ناروغیو کنټرول او مخنیوي ولایتي مرکز (ژیجیانګ CDC) په مشرۍ یوه مقاله خپره کړه، چې د بیجینګ میکرو او مایکرو ټیسټ بایو ټیک شرکت، لمیټډ او د ساري ناروغیو کنټرول او مخنیوي ملي انسټیټیوټ (چین CDC) د بایو انفارمیټکس ټیم سره د شریک لیکوالانو په توګه وه. د مطالعې سرلیک دی:
"د چین په ژیجنګ کې د اوو بروسیلا ابورټس ډولونو پیژندنه او فایلوجینیټیک تحلیل."

دا څېړنه د چین په ژیجنګ ولایت کې د بروسیلا ابورټس (B. ابورټس) د لومړي سیستماتیک، بشپړ جینوم پر بنسټ د فایلوجینیک تعقیب وړتیا تحلیل استازیتوب کوي. ټیم د 2015 څخه تر 2025 پورې راټول شوي اوه جلا شوي ډولونه تحلیل کړل (څلور د انسان اصلي او درې د غواګانو اصلي ډولونه د جین هوا، کوژو او نینګبو څخه). موندنې د ختیځ چین په یوه غیر معمولي سویلي وبا سیمه کې د دې "شمالي غالب ډولونو" د اصل او لیږد لارو لپاره جینومیک شواهد چمتو کوي.

پس منظر او اهمیت

بروسیلوسس یوه زونوټیک ناروغي ده چې د بروسیلا نسل د باکتریا له امله رامینځته کیږي. بروسیلا ابورټس په عمده توګه غواګانې اخته کوي مګر کولی شي په انسانانو کې هم ناروغي رامینځته کړي. په چین کې، بروسیلوسس د پام وړ جغرافیایي توپیر ښیې: ترټولو لوړه پیښې په شمالي ولایتونو کې پیښیږي (د بیلګې په توګه، داخلي منګولیا، شانسي، هیلونګجیانګ). برعکس، سویلي ولایتونه، په شمول د ژیجیانګ، په تاریخي ډول د بروسیلا میلیتینسیس لخوا تسلط لري، د B. ابورټس ډیر لږ راپور شوي قضیې سره. دا سیمه ایز توپیر په ژیجیانګ کې د B. ابورټس جینیاتي ځانګړتیا او د سرچینې تعقیب د عامه روغتیا کلیدي لومړیتوب ګرځوي.

میتودونه او کلیدي موندنې

د څېړنې ټیم یوه څو اړخیزه ستراتیژي غوره کړه چې مالیکولي بیولوژي او بایو انفارماتیک سره یوځای کوي:

1.د ناروغۍ پیژندنه او اساسي ټایپ کول

د BCSP-31 جین PCR او AMOS-PCR تایید کړه چې ټول اوه جلا شوي ډولونه د B. ابورټس وو.

د نهو کور ساتنې جینونو پر بنسټ د ملټي لوکس سیکوینس ټایپینګ (MLST) څرګنده کړه چې ټول جلا شوي د سیکوینس ډول ST2 پورې اړه لري، چې په ژیجیانګ کې د گردش کونکي B. ابورټس ډولونو ترمنځ لوړ جینیاتي یووالي په ګوته کوي.

2.د بشپړ جینوم ځانګړتیا

د بشپړ جینوم ترتیب د ایلومینا نووا سیک پلیټ فارم کې ترسره شو. د نیوکلیوټایډ هویت (ANI) اوسط تحلیل ښودلې چې د ژیجیانګ جلا شوي اجزا د حوالې فشار B. abortus 544 سره تر 99.99٪ پورې ورته والی شریک کړی.

د پان جینوم تحلیل د نفوس خورا خوندي ساتل څرګند کړ: 3,084 اصلي جینونه پیژندل شوي، د یوازې 10 شیل جینونو سره، او هیڅ نرم کور یا کلاوډ جینونه ونه موندل شول.

3.د ویروس او انټي مایکروبیل مقاومت جین پروفایلونه

په ټولیزه توګه د ویروس پورې اړوند ۶۸ عوامل وړاندوینه شوي، چې کلاسیک لارې لکه LPS بایوسینتیز، د T4SS سرایت سیسټم، او BvrR-BvrS دوه برخې تنظیمي سیسټم پوښي. د پام وړ، ټولو جلا شویو کې د اډیسین جینونه bmaA او btaF نه وو. د مقاومت جین تحلیل یوازې د CARD ډیټابیس کې mprF جین کشف کړ، پرته له دې چې نور مقاومت ټاکونکي وپیژندل شي.

۴. د فایلوجینټیک بیارغونه او د لیږد تعقیب

د کور-جینوم واحد-نیوکلیوټایډ پولیمورفیزم (cgSNP) تحلیل د ژیجیانګ جلا شوي توکي د نړیوال فیلوجینټیک ونې په ځانګړي موقعیت کې ځای په ځای کړل. پایلو وښودله چې د ژیجیانګ ډولونه د روسیې، منګولیا او څو شمالي چینایي ولایتونو (نینګشیا، هیلونګجیانګ، داخلي منګولیا، هیبي، ګانسو، بیجینګ) څخه د ژیجیانګ جلا شوي ډولونه سره یوځای یو مونوفیلیټیک ګروپ جوړوي. دا ډله نور په دریو جلا فرعي کلیډونو ویشل کیږي (کلیډ 1-3)، چې د څو خپلواکو معرفي پیښو وړاندیز کوي.

پایلې او پایلې

دا څیړنه په ژیجیانګ ولایت کې د B. abortus لومړی لوړ دقت جینومیک ډیټاسیټ چمتو کوي او څو مهمې پایلې راوړي:

1. کلیar جینیاتي پس منظر– په ژیجنګ کې د B. ابورټس ډولونه چې گردش کوي د ST2 پورې اړه لري، په جینومیک ډول خورا ساتل شوي، او د غواګانو د بروسلوز نسب استازیتوب کوي.

2. ایويد سیمه ییزو سیمو د لیږد دلیل- د فیلوجینټیک تحلیل په ژیجنګ کې د خپلواکې سیمه ایزې نسب شتون ملاتړ نه کوي. پرځای یې، معلومات په کلکه وړاندیز کوي چې دا ډولونه د شمالي چین څخه سرچینه اخلي او ممکن د روسیې او منګولیا د ډولونو سره یو ګډ ارتقايي پس منظر شریک کړي. د دریو فرعي کلیډونو شتون د څو جلا معرفي پیښو معنی لري.

3. د عامې روغتیا اغیزې- موندنې د بروسلوز لپاره د جینومیک څارنې ارزښت په ګوته کوي حتی په دودیز ډول په غیر سیمه ایزو سیمو لکه ژیجیانګ کې. که څه هم د قضیو اوسنی شمیر ټیټ دی، د cgSNP په څیر لوړ ریزولوشن وسیلې کولی شي په مؤثره توګه د وارد شوي وبا سرچینه تعقیب کړي او د بین الصوبایي څارویو لیږد سره تړلي د لیږد زنځیرونو د مداخلې لپاره ساینسي شواهد چمتو کړي.

دا کار نه یوازې په ژیجنګ ولایت کې د څیړنې تشه ډکوي بلکه د یانګزي سیند ډیلټا سیمه کې د ناروغۍ څارنې او د بروسلوز د خطر ارزونې لپاره نوي اساسی معلومات هم چمتو کوي.

د کاغذ معلومات:
یانګ، وای، شی، ایکس، چن، جي، وانګ، ایل، وو، زی، یاو، ډبلیو، ... او وو، بي (۲۰۲۶). د چین په ژیجنګ کې د اوو بروسیلا ابورټس ډولونو پیژندنه او فایلوجینیټیک تحلیل. د حجروي او انتان مایکروبیولوژي کې سرحدونه، ۱۶، ۱۷۵۸۹۶۵.